[Ui_policytable_java_spe_policy 이피통 노트북] [노트북을] 싶다 사용할 수 있는 방법이라고 할 수 있는 일부 게놈 분석 차트를 대화식으로 실로나는 Biopython& # 39 의 ['게노메디아그램'] [게노메디아그램] 모듈에서는. 그곳에 있는 동안 사용 방법에 대한 '에서' 는 다양한 문서 매플로리브 afaq 그래프 이피통 게노메디아그램 soundmixer. 레포트라브 도구키트 어떤 난 노트북, 인라인, don& # 39 에 대한 지원은 인라인 그래프 이피통 있는 것 같지는 않다.
그러나 제 생각에 이 주위에 약간만이라도 방법을 쓸 수 있는 이미지 파일 열기 / 게놈 플롯할 아웃해야 구성도를 후 이 같은 일이 있는 인라인 동일한 결과를 초래할 수 있을 것이라고 말했다.
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
하지만, 제가 can& # 39, t, s # 39 이 방법에 -또는 다운로드되었는지 it& 알아낼 수 있습니다. 그래서 열 수 있는 이미지 / 표시되려면 이피통 다운로드되었는지 누구?
[게노메디아그램]: http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html # sec329
이 게시물로의 의 동의 하에 다음과 같이 할 수 있습니다.
from IPython.display import Image
Image(filename='test.png')
([공식 문서] [2])
[2]: http://ipython.readthedocs.io/en/stable/api/generated/IPython.display.html = 디스플레이 # 이피톤스트리스프레이드리마거 강조표시할?
이렇게 하면 가져오기의 및 디스플레이 'a' 의 이미지를 주피터 (2.7 의 파이썬 함께 테스트되었습니다 아나콘다 환경) .jpg
from IPython.display import display
from PIL import Image
path="/path/to/image.jpg"
display(Image.open(path))
이 입력하여 완료되어도 에 아나콘다
conda install pillow
이 때 내가 찾은 페이지이므로 교수 등 이 # 39 위에 didn& 협력했습니다 제안, t:
import PIL.Image
from cStringIO import StringIO
import IPython.display
import numpy as np
def showarray(a, fmt='png'):
a = np.uint8(a)
f = StringIO()
PIL.Image.fromarray(a).save(f, fmt)
IPython.display.display(IPython.display.Image(data=f.getvalue()))
'을 (를 사용할 때' (이피통), 가장 쉬운 방법은 게노메디아그램 주피터 표시하십시오 이미지는 PNG 이미지 게노메디아그램 변환함으로써. 이 사용 할 수 있는 디스플레이 랩된 이피톤스트리스프레이드리마거 객체에는 노트북.
from Bio.Graphics import GenomeDiagram
from Bio.SeqFeature import SeqFeature, FeatureLocation
from IPython.display import display, Image
gd_diagram = GenomeDiagram.Diagram("Test diagram")
gd_track_for_features = gd_diagram.new_track(1, name="Annotated Features")
gd_feature_set = gd_track_for_features.new_set()
gd_feature_set.add_feature(SeqFeature(FeatureLocation(25, 75), strand=+1))
gd_diagram.draw(format="linear", orientation="landscape", pagesize='A4',
fragments=1, start=0, end=100)
Image(gd_diagram.write_to_string("PNG"))
[[지켜보리니 노트북]] (https://gist.github.com/sbliven/bfa88fd1f4d3365f6d6170611945fa39)
Python3 클리너, 누마피 매플로리브 사용하는 표준 버전 및 필승. 답을 병합합니다 열기 위한 URL 에서.
import matplotlib.pyplot as plt
from PIL import Image
import numpy as np
pil_im = Image.open('image.png') #Take jpg + png
## Uncomment to open from URL
#import requests
#r = requests.get('https://www.vegvesen.no/public/webkamera/kamera?id=131206')
#pil_im = Image.open(BytesIO(r.content))
im_array = np.asarray(pil_im)
plt.imshow(im_array)
plt.show()